Acétylation N-terminale et amidation C-terminale

Un peptide linéaire non modifié a deux extrémités chargées : une amine N-terminale (–NH3⁺) et un carboxylate C-terminal (–COO⁻). Les bloquer chimiquement est l’une des modifications les plus courantes des peptides de synthèse. Elle se lit dans le nom : « Ac- » au début, « -NH2 » à la fin.

Les deux modifications

Acétylation N-terminale (Ac-). L’amine terminale est convertie en amide par un groupe acétyle (CH3CO–). Formule : + C2H2O. Masse : +42,0 Da. La charge positive N-terminale disparaît.

Amidation C-terminale (-NH2). Le carboxyle terminal –COOH devient un carboxamide –CONH2. Formule : − O + N + H. Masse : −1,0 Da. La charge négative C-terminale disparaît.

Pourquoi modifier les extrémités

1. Imiter la protéine d’origine. Beaucoup de peptides naturels sont acétylés ou amidés. Le VIP, la kisspeptine-10 et la sermoréline sont amidés comme leurs homologues endogènes ; la thymosine α1 et la thymosine β4 sont acétylées.
2. Mimer un fragment interne. Un fragment découpé au milieu d’une protéine n’a pas d’extrémités libres dans la protéine entière. Bloquer ses extrémités, comme pour le TB-500 (acétylé), le rapproche de cette situation.
3. Résister aux exopeptidases. Les aminopeptidases attaquent l’amine libre, les carboxypeptidases le carboxyle libre. Bloquer les deux extrémités ralentit leur action, ce qui intéresse les études de stabilité in vitro.
4. Changer la charge. Supprimer une charge modifie solubilité, point isoélectrique et rétention.

Effets mesurables

Effet	Acétylation	Amidation
Masse	+42,0 Da	−1,0 Da
Charge à pH 7	−1 (perte d’un +)	+1 (perte d’un −)
Rétention HPLC phase inverse	Augmente	Augmente légèrement
Ionisation ESI	Un site de protonation en moins	Inchangée en général

Exemples du catalogue

Peptide	Forme	Extrémités
Semax	Libre	NH3⁺ / COO⁻
N-acétyl Semax amidé	Bloqué	Ac / NH2
Argireline	Bloqué	Ac / NH2
Ipamoréline	Amidé	NH2 libre (Aib) / NH2
TB-500	Acétylé	Ac / COO⁻
Ac-SDKP	Acétylé	Ac / COO⁻

La comparaison Semax / N-acétyl Semax amidé est développée dans Selank et Semax : deux heptapeptides et leurs formes amidées.

Comment on les obtient

• Amidation : la synthèse est conduite sur une résine « amide » (Rink amide, Sieber). Le clivage libère directement le peptide amidé. Aucun coût supplémentaire significatif.
• Acétylation : après le dernier couplage, l’amine N-terminale est traitée par l’anhydride acétique sur la résine. Simple et quantitative.

Voir Synthèse peptidique en phase solide.

Les contrôler sur un rapport

Une modification oubliée ou incomplète se voit en spectrométrie de masse : un Semax « N-acétylé amidé » qui montrerait une masse de 813,9 au lieu de 855,0 ne serait pas modifié. Une acétylation partielle donne deux pics HPLC séparés de 42 Da. Le calcul des masses attendues est expliqué dans Calculer la formule brute et la masse molaire.